背景介绍与DA行动：新闻报道宣布东京樱花盛开，并提到象征和平的新信号塔“延空树”即将竣工，取代了十年前发生“痛心事故”的旧信号塔。同时，一个代号Alpha的DA（Direct Attack，彼岸花所属组织）行动正在进行，目标是抓捕枪支商人。行动因黑客“核桃”入侵系统导致彼岸花成员陷入危机，一名彼岸花成员艾丽卡被挟持。泷奈违抗命令：现场的彼岸花成员泷奈不顾上级“待命”的命令，为了营救被挟持的艾丽卡，选择开枪射击敌人，成功解救了艾丽卡，但导致目标枪支和部分敌人逃脱或死亡。泷奈被调职：由于在任务中擅自行动并导致作战失败，泷奈被DA司令楠木处以调职处分。她被告知要向一个虽然任性但很优秀的彼岸花学习。抵达LycoReco咖啡馆：泷奈的新工作地点是一个名为“LycoReco”的日式咖啡厅。她在这里见到了她的新搭档千束（那位被誉为“东京第一的彼岸花”，也是十年前旧信号塔事件的守护者），以及咖啡馆的管理者米卡（泷奈称呼为老师）和曾在DA情报部的水木。了解LycoReco的运作：泷奈发现LycoReco不仅是咖啡馆，还接受各种委托，帮助那些DA和警方不愿或无法处理的麻烦。咖啡馆成员各有特长，日常工作包括送咖啡、教外语、在幼儿园帮忙等，目的是帮助有困难的人。千束的理念与过去：千束告诉泷奈，LycoReco的工作是帮助DA不在乎的那些需要帮助的人。她用非致命性子弹，强调珍惜生命，包括敌人的生命。泷奈了解到千束就是十年前旧信号塔事件中独自守塔的彼岸花，那起事件被DA对外宣称为“煤气爆炸”。千束认为自己是“问题儿童”，所以不在DA总部。接受跟踪狂委托：一位名叫阿部的警视厅刑警来到LycoReco，委托千束和泷奈处理一起警方无法介入的跟踪狂案件。委托人是一位名叫篠原沙保里的小姐，她在网上发布照片后，自己和男友就不断被可疑人物跟踪。照片中的线索：沙保里小姐提供的照片是在煤气爆炸事件（即旧信号塔事件）发生大楼附近拍摄的。千束注意到照片拍摄时间在爆炸前几小时，并推断出照片意外拍到了枪支交易现场，跟踪沙保里的人正是当时购买枪支的一方，目的是销毁照片。诱饵与伏击：为了抓捕跟踪沙保里的人并查明枪支去向，千束决定让沙保里跟着她们，并在送她回家的路上故意暴露行踪，引诱跟踪者发动袭击。泷奈对此感到不适，认为拿委托人当诱饵过于冒险，但千束认为敌人只想要照片不会伤害沙保里。千束的战斗与核桃的出现：在随后的交火中，千束展示了她使用非致命性子弹快速制服敌人的能力，并击落了一架监视她们的无人机。事件结束后，千束联系DA派出“清扫工”处理被制服的敌人，解释说如果交给DA总部，这些人性命不保。此时，黑客“核桃”通过某种方式与他们联系，暴露了自己对DA和彼岸花秘密的了解，并提及了“阿兰机关”和“施舍之神”，暗示了事件背后更深层的原因和目的。泷奈回归总部的契机：千束告诉泷奈，这次事件中被攻击沙保里小姐的照片确实拍到了枪支交易，但时间比DA情报中说的更早。她们抓捕了袭击者，这可能能帮助泷奈查清枪支下落，从而找到回归DA总部的机会。LycoReco的日常延续：回到咖啡馆后，千束为了宣传店铺，立即将她们与沙保里的合影发到了社交媒体上，不顾泷奈之前关于随意发照片会惹麻烦的担忧。最后，咖啡馆迎来了新的顾客，大家继续扮演着咖啡馆店员的角色。
section1：某人正在讨论世界级的神秘赞助机构阿兰机关，该机构资助有才能但贫困或残疾的人才，涉及广泛领域。对话中提到有人试图杀害说话者（被称为“那家伙”），并且该人知道说话者的住址，对此感到疑惑。section2：袭击说话者的人向其展示一段无人机拍摄的视频，确认他们找到了说话者的真实住处。说话者认出对方是“核桃”，并指责“核桃”出卖了自己。随后，“机器仔”宣布自己找到了“核桃”，并宣称自己即将成为日本最强的黑客，威胁要取代“老人家”。同时，出现一条来自“核桃”的紧急求助信息。section3：镜头转到咖啡馆LycoReco。吉叔来访，表示已有约一个月未见。吉叔是泷奈的第一个客人，他带来了俄罗斯的伴手礼。千束好奇地询问吉叔是否在俄罗斯认识“老师”。吉叔回避了问题并先行离开。section4：千束询问任务的紧急程度，被告知正受到武装集团追赶，敌人数量约5到10人，具备准军事水平，持有步枪。泷奈表示了解任务概要。水木去确保逃跑路线，据称这次任务报酬是市场价的三倍。任务是与一位黑客会合。section5：千束和泷奈在列车上。千束猜测雇主黑客会是一个瘦小的四眼仔。泷奈喝着果冻饮料，似乎没有认真听千束讲解的逃跑计划，包括快速换乘的细节。千束试图让她吃便当里的水煮蛋。随后，泷奈解释快速换乘所以才吃方便的果冻，千束意识到泷奈确实没听讲解。section6：在另一地点，有人讨论暗网流传的“核桃”死讯，但因其身份不明且常有死讯，认为流言不可信，希望能丢失的情报随“核桃”一同消失。他们分析了LycoReco提供的照片，确认照片拍摄于作战前，但交易时间是假的，认为己方失职。他们正尝试修复一张模糊的照片。section7：回到车站，千束询问与黑客会合后如何去羽田机场，再次暴露自己没听讲解。泷奈告知店长安排了车在停车场。她们来到停车场，看到一辆帅气的超跑，千束非常兴奋想开，但泷奈觉得太显眼。这时，一辆货车驶来，车里的人用暗号“核桃”表明身份。他们发现追兵逼近，催促千束和泷奈上车，放弃了超跑。section8：坐在货车里，千束和泷奈惊讶于保护对象竟开着货车出现，且是穿着玩偶服（熊）的小女孩。女孩自称“核桃”，并解释穿玩偶服或女高中生制服（像Lycoris）是在日本都市中最不易被警惕的伪装。她有一个装满全部家当的大箱子，计划逃往国外。千束提到自己没有户口无法办理护照。她们注意到追兵没有跟来。section9：核桃指示前往计划中的换车点。与此同时，追兵向领导报告在公园附近跟丢。领导斥责他们无能。货车行驶中，核桃发现汽车被“机器仔”黑入，正在加速驶向海边。她解释即使夺回控制权，“机器仔”也能迅速改写。她提议物理切断网络连接。千束找到路由器，泷奈开枪打中，但核桃说没用。section10：货车坠毁。三人在附近的超市躲藏。追兵领导指示手下，目标有武装保镖，必须谨慎行动。追兵发现三人有枪。一名追兵冲入超市，并拿核桃的行李箱做盾牌。千束阻止泷奈攻击拿箱子的人，强调箱子的重要性，认为泷奈的要求不可能做到。section11：水木赶到并中枪流血。核桃试图救治，被千束阻止。水木坚持进行应急处理，称那名追兵会死。千束催促核桃和泷奈按逃跑路线先走，自己会追上。千束为受伤的追兵止血。她告诉追兵自己用的是橡皮子弹，并提醒他补充铁质。核桃用无人机发现追兵要走的路线有埋伏，千束及时阻止了那名追兵。泷奈试图出去战斗也被千束阻止。section12：“机器仔”向上级报告成功“击杀”目标（核桃），并询问是否要干掉女保镖，得到否定答复。追兵们根据报告回收遗体和行李撤离。千束提议去吃饭。“机器仔”向上级邀功，宣布自己成为日本最强黑客。上级表扬“机器仔”是合格的“道具”。section13：泷奈向千束道歉，千束表示这不是她的错。回到LycoReco，核桃和水木安然无恙。水木解释她的衣服能防弹，血液喷溅效果是为了伪造死亡。核桃脱下玩偶服，露出了真实的身份：一个年幼的女孩。她解释让追捕者相信自己已死是最好的逃脱方法。section14：水木对没有被告知计划感到不满，核桃解释水木演戏不自然，所以让她自然反应。水木拿出一段视频，是千束为受伤追兵止血的画面，质疑千束的非杀伤方针，认为Lycoris有权杀人。千束认为对方只是当时的敌人，没人牺牲是好事。核桃调解争执，承认己方的欺骗战术也有问题。“老师”端来点心。水木虽然嘴上拒绝但还是吃了。泷奈去拿坐垫。section15：水木似乎对千束的表现感到困惑。核桃请求暂时住在LycoReco，并提出以帮助她们的工作为条件。店长答应并让她不要弄乱房间。泷奈拿出之前模糊的照片，请核桃帮忙找出照片背景中的小个子男人。核桃提升了照片分辨率。吉叔来到咖啡馆，称赞店长的点心，并问及店长与千束在此地从事的工作。section16：胡桃提升了照片清晰度。千束问核桃的真名，因为“核桃”已经“死了”。女孩回答“胡桃”（Kurumi），只是核桃的日文发音。千束和泷奈觉得这个名字很适合她，并欢迎胡桃加入。老师邀请大家出去吃团子，泷奈表示同意但似乎不小心受伤了。
回顾过去的任务失败：场景快速闪回，显示了在任务中发生通信中断的情况。一名Lycoris特工报告与司令部通讯中断，并面临人质（艾丽卡）被威胁生命的紧迫情况。尽管有危险，另一名特工（泷奈）似乎做了可能违反命令的决定，导致了冲突和人员伤亡。咖啡馆的日常与DA的线索：LycoReco咖啡馆，锦木千束、中原瑞希和胡桃正在查看一张照片。他们讨论DA情报部门对照片的分析能力不足，并对胡桃能够超越DA的能力感到兴奋。瑞希似乎因为某种原因生气。咖啡馆打烊，大家准备进行桌面游戏会。泷奈正在清点现金并核对账目，她婉拒了加入游戏的邀请，表示想回DA。前往DA总部：千束和泷奈讨论泷奈想回DA的愿望。千束被米卡提醒需要完成体检和体能测试才能更新资格证，并让她如果想继续工作就必须去做。千束开玩笑地让米卡向楠木司令求情。泷奈听到他们要去见司令，请求带她一起去。千束同意了，尽管对泷奈如此迅速决定感到惊讶。DA总部的遭遇：千束和泷奈抵达DA总部，受到接待。千束被告知去医疗塔进行体能测试。泷奈表示想立即见楠木司令，但被告知司令正在开会，需要等两个小时。其他Lycoris特工注意到泷奈，并低声议论她是违反命令、枪指同伴并导致同伴受伤的“同伴杀手”，对她被赶出DA议论纷纷。泷奈决定等待。与楠木司令的对质：泷奈在训练场附近等待。千束完成体能测试后遇到风希，两人谈论米卡和LycoReco咖啡馆。风希批评千束的散漫态度，并质疑千束为何带泷奈来，认为泷奈不该想回到DA。楠木司令出现，批评千束未履行义务却想要特权。泷奈抓住机会向司令询问自己被开除的原因。楠木重申是因泷奈违反命令导致千支枪下落不明且未能击杀商人。泷奈辩称她救了同伴。千束出示了一张照片，并指出是司令部错误传递了交易时间，暗示司令也有责任。千束进一步质疑通信故障是否是因“放射线”系统被黑所致，认为这是个大问题。楠木否认黑客入侵，称只是技术问题，并斥责独断专行的Lycoris无用，宣布泷奈的继任者已经到来。泷奈的失落与千束的鼓励：新来的Lycoris乙女樱被介绍为风希的新搭档，接替了泷奈的位置。樱对泷奈进行言语嘲讽，称她是“同伴杀手”且DA已不再需要她。泷奈再次尝试向楠木司令呈交新情报，希望能以此重回DA，但司令明确表示从未承诺此事。泷奈感到绝望。风希和樱继续嘲讽泷奈，风希甚至动手打了泷奈，直言DA不要她了。千束为泷奈辩护。泷奈跑开，千束找到了她。阐明真相与指引新方向：泷奈向千束倾诉渴望回到DA的宿舍生活，将其视为自己的归宿。千束表示理解，但告诉泷奈城市里仍有很多人需要她的帮助。千束向泷奈解释了她被开除的真正原因：那次任务的通讯故障并非意外，而是DA最强AI“放射线”系统被黑，导致交易时间错误，DA高层为掩盖黑客入侵的事实，将责任推给了违反命令的泷奈。千束劝泷奈放弃与司令的对质，因为对方只会推诿。千束鼓励泷奈继续前进，失去有时也会有所得，比如她们因此相遇。她认为为了迎合他人期待而难过是无意义的，告诉泷奈她在咖啡馆有自己的位置，可以尝试新的生活。她强调机会总会到来，届时应选择自己真正想做的事。模拟战与伙伴的支持：广播通知即将举行情境演习。其他Lycoris，包括艾丽卡，聚集在观战台，议论泷奈将与风希进行模拟战，期待风希为受伤的艾丽卡报仇。艾丽卡表示自己没有仇，承认泷奈救了她。风希和樱讨论模拟战的策略，樱对千束出言不逊。模拟战开始，风希和樱对抗千束。千束轻松躲避了樱的射击，并多次“击杀”了试图近身的樱。风希意识到千束在等待某人。泷奈抵达，决定加入模拟战，作为千束的搭档。泷奈迅速用体术击败了樱。模拟战的结局与新的开始：千束也击败了风希。风希承认千束的强大洞察力。模拟战结束。风希再次嘲讽泷奈，称她选择拳击而不是射击是愚蠢的，并重申DA不要她了。千束问泷奈是否在模拟战中朝她开枪了。泷奈承认是故意的，因为她相信千束能躲开。泷奈称千束是“反常识”的人，并表示心情好多了。泷奈收到咖啡馆关于桌面游戏会加时赛的短信，并被邀请参加。泷奈声称自己被邀请，并决定和千束一起回去参加游戏会，象征着她找到了新的“归宿”。后续：泷奈确认了收到关于咖啡馆游戏会加时赛的通知，并决定与千束一同回去参与，最终确定了她们共同前往的决定。
section1：在咖啡店的地下靶场，泷奈进行射击训练，对无法命中目标感到沮丧。千束提出靠近目标射击，称自己无法做到是因为命中率不足以保护自己。米卡评论千束在店里建靶场的行为，认为虽然花费大，但有备无患。千束称赞泷奈枪法精准，能避开要害，并提及自己使用的非致命子弹不是老师给的。泷奈质疑这是否还是她们彼岸花的工作。section2：千束和泷奈玩赛车游戏，泷奈因名字让人火大的对手而感到不甘心。千束接手后，以激进的方式迅速赢得比赛。泷奈惊讶于千束突然改变的战斗风格，并觉得她对网络游戏过于认真。section3：千束向胡桃打听泷奈穿不穿内裤的习惯。随后，千束发现泷奈穿着男士紧身短裤。泷奈解释这是店长（米卡）指定的。米卡辩解称自己不知道怎样的内裤好，只是建议自备，而紧身短裤是因为他觉得穿起来爽身。千束批评米卡，并决定第二天带泷奈去买女性内裤，要求她穿自己的便服前来。section4：第二天，千束在车站等待，泷奈穿着一条裙子前来，让千束眼前一亮。泷奈带着枪，千束提醒她在外面不要随便拔枪。泷奈询问千束的衣服是否是演出服，千束表示自己平时只有制服。千束建议泷奈也买一条裙子，表示肯定很适合她，并主动提出帮忙挑选。泷奈同意，千束对此感到非常兴奋。section5：胡桃在店里泡澡同时监控黑市武器行情。她和米卡讨论行情没有变化，意味着被盗的一千支枪尚未流入黑市，因此无法通过此线索追查。他们猜测这些枪可能武装一支五百人的部队，并质疑DA为何未能发现。千束和泷奈联系他们，米卡告知她们傍晚才能回店。section6：千束和泷奈一起逛街购物。千束试穿各种裙子，泷奈称赞她可爱。千束建议泷奈试用唇彩。随后她们来到内衣店，泷奈希望能买到适合工作/枪战的内衣，千束觉得荒谬。千束描述了自己穿的透气舒适的内衣，称是米卡推荐的。泷奈质疑米卡的品味，并问内裤是否万一需要给别人看。泷奈要求看千束的内裤，想知道是否“见得光”。千束一开始拒绝，但最终让泷奈看。泷奈评论不适合自己。千束表示要和男士紧身短裤告别，并确认已将米卡的此类内裤全部扔掉。section7：购物后，千束拉着泷奈去吃高卡路里甜点。泷奈认为目标已达成，但千束坚持这并非工作，只是想和泷奈一起享受。她们点了一道复杂的松饼。泷奈担心长胖会成为弱点，但千束认为美食值得，可以通过跑步消耗。她们愉快地享用点心。section8：千束带泷奈来到水族馆，称之为“好地方”。她表示喜欢这里，有年票。泷奈对一些奇异的鱼类感到好奇，思考它们变成这样是否有合理原因。千束模仿花园鳗，引人注意。泷奈提醒她作为彼岸花不应如此张扬，特别是在没穿制服的时候。千束反驳说不穿制服就不是彼岸花。她们观看巨大的水族箱。section9：在水族馆，泷奈问千束何时开始使用非致命子弹。千束说是旧电波塔事件时。泷奈问原因，千束开玩笑说她对自己感兴趣。千束解释说她觉得夺走别人的时间让她不舒服，尤其被坏人惹得不高兴时更不舒服，所以不杀人，只让他们体验比死更难受的痛苦。泷奈对此感到意外，原以为有更博爱的理由，并称千束是个谜团重重的人。千束表示自己只是把想做的事放第一位。泷奈问她离开DA是否也是同样原因，因为留在DA也能选择不杀人。千束停顿后，透露她在找一个非常重要的人，并展示了她佩戴的带有鸟图案的吊坠。她向泷奈展示了关于匿名赞助者“阿兰”和“阿兰之子”的新闻报道，报道中提及受赞助者会收到带有鸟图案的吊坠。泷奈确认吊坠一模一样。泷奈问千束的天赋是什么，千束开玩笑不是选衣服。泷奈问她是否找到那位赠送吊坠的人，千束说没有，找了十年，可能永远见不到，她只是想对那个人说声谢谢。section10：千束继续在水族馆里模仿花园鳗，泷奈也加入。泷奈说千束的可爱之处不用隐藏，千束听后很高兴。千束接着提议去企鹅岛。section11：画面切换到米卡和吉松信二。吉松问米卡回来的原因，米卡说是想见他，吉松则认为是为了千束。吉松提到千束不记得他，因为当时只见了一次。米卡问吉松为何不告诉千束，因为她一直在找他。吉松称阿兰机关严禁与赞助对象接触，米卡也知道这一点。米卡指出吉松自己却来了咖啡馆。吉松问米卡是否希望他消失，米卡否认。吉松问米卡是否还在遵守约定。米卡肯定回答。吉松谈论天才应为世界所知，此时电视新闻播报一位钢琴家宣布成为“阿兰之子”。吉松随后称千束是“举世罕见的天才杀手”。section12：真岛在一个房间里，闻着空气的味道，认为是经过掩盖、不健全的谎言的味道，表示是时候恢复平衡了。section13：地铁事故现场，许多彼岸花在场。真岛出现，观察她们。一列地铁发生碰撞脱轨。真岛毫发无伤。他认出了彼岸花。千束和泷奈赶到，在便服下掏枪。真岛指出她们穿便服掏枪会被警察抓，并提及千束说过没穿制服就不是彼岸花。他让她们今天回去，因为自己已经拿到了很多“战利品”。section14：电视新闻报道北押上站地铁脱轨事故，称是自动驾驶空车，无人伤亡。咖啡馆里，胡桃和米卡玩牌，看到新闻，胡桃庆幸是空车。她们看到新闻里的记者像熟人，推测他当天不会来了。米卡对警察无法进入现场、没有目击者的报道感到怀疑，认为背后有隐情。section15：千束和泷奈回到咖啡馆。千束扔掉男士内裤。瑞希回来看到，指责千束行为不检点。千束否认，说是泷奈的，店长（米卡）指示她买的。瑞希更糊涂了。千束想逃避，瑞希追赶，大喊“异端叛徒大骗子”，并向大家展示泷奈的新内裤。section16：楠木司令打电话给千束，询问关于被盗枪支的情况。千束表示知情。section17：瑞希继续展示男士内裤，大声说是男用的，千束极力否认和解释，但越描越乱。section18：真岛观看事故新闻，注意到无人伤亡，认为这些扰乱日本平衡的人很有意思。section19：真岛接到自称“机器人”的电话。机器人提到事故报道和彼岸花存在被限制外流的情况。机器人是世界第一黑客，希望与真岛合作打败彼岸花，提供自己的头脑和真岛的力量。真岛挂断了电话。section20：真岛自言自语，决定制造更大的事件，让真相无法被掩盖。他表示“好了…开始吧”。
地铁脱轨事故背景与新任务：报道回顾了一个月前的地铁脱轨事故，指出事发地铁站仍未恢复运营，乘客多有不满。事故涉及自动行驶的回送列车，奇迹般无人员伤亡。当局承诺尽快查明原因。随后，LycoReco咖啡馆团队接到新任务，委托人是一位72岁的日本男性，曾在美国避难，因家人遇害且自己生命受威胁。他现患有肌萎缩性脊髓侧索硬化症（渐冻人症），时日无多，希望能回到故乡东京看看。团队的任务是担任他的保镖，因他仍有被袭击的风险。委托人身份是大企业高管，树敌众多，但具体被谁盯上不明。报酬丰厚。团队着手为他制定观光计划。接待委托人与东京观光开始：委托人松下先生提前抵达，表示很期待。团队向他展示了精心准备的东京观光计划册。松下先生谈到自己靠机械维持生命，千束则透露自己也一样，拥有一个完全机械的、不会跳动的人工心脏，并开玩笑说自己是“铁石心肠”。随后，众人乘坐水上巴士开始观光，松下先生对选择水路避免拥堵表示赞赏。途中经过一处断裂的建筑，松下先生提到这是他第一次来东京，曾与女儿约定一起看，现在能将这份经历带给已逝的女儿了。浅草文化体验与地铁事故调查并行：观光团队来到浅草寺，千束介绍雷门及其风雷神像的典故，将神明比作保镖。接着游览仲见世商店街，讲述浅草寺起源于一位渔夫在隅田川网到观音佛像的传说。与此同时，两名刑警私自进入发生事故的地铁站调查，发现了大量子弹，推断事故并非意外而是恐怖袭击。他们讨论向上级汇报，但也提到自旧电波塔袭击后，许多案件都作为意外处理，怀疑是有人隐瞒真相，甚至局长也在听命行事，对此感到无法接受和无奈。偶遇刑警与关于人工心脏的讨论：在七夕节的活动现场附近，千束和泷奈偶遇了之前认识的刑警阿部先生。阿部先生得知她们在带客人观光，夸赞千束是个好女孩，并表示只要像她这样的女孩能安心生活，无论是谁隐瞒真相都无所谓。随后，团队继续观光，胡桃通过监控系统讨论千束人工心脏的非凡性能，怀疑是阿兰机关的技术。米卡证实了这一点，并提到这是阿兰机关赋予千束的新生，她担负着世界的使命，但使命的内容由她自己决定。松下先生提及延空树（晴空塔），表示朋友参与了设计，等完工后要再来，让千束做导游。遭遇刺客“刃”的袭击：米卡通过监控发现有人跟踪他们，并认出对方是代号“刃”（静刃）的老练刺客，是他15年前在安保公司时曾共事的对象，为人沉默寡言。胡桃计划安装信号发送器。刃被发现后，米卡更改计划，要求疏散委托人，由一人迎敌。胡桃前往安装信号器但暴露位置。米卡警告刃不好对付，敦促胡桃和备用无人机尽快到位。水木负责开车接应。胡桃与水木失去联络，备用无人机未启动。米卡让胡桃联系千束和泷奈，告知水木失联和刃的动向。泷奈主动要求迎敌，千束让她留在委托人身边。胡桃利用监控和无人机进行监测。水木脱困与松下先生的失踪：水木被绑架，但成功挣脱并联系了LycoReco咖啡馆，表示自己被算计了。米卡得知水木平安后，指示她立刻前往东京站站台接走松下先生。与此同时，泷奈在美术馆附近追赶刃。千束联系松下先生，但发现他不见了。胡桃通过监控找到松下先生藏身在室外机后。委托人暴露真实目的与身份：松下先生现身，询问刃是否已到，并透露刃是杀害他家人的人，一定会来杀他。他拒绝避难，声称自己时日无多，必须在日本亲手解决此事。胡桃报告泷奈甩掉了刃，警告千束小心。松下先生向千束摊牌，称自己的真正委托是让她杀死刃。他知道千束吊坠的含义，并称她有自己的使命，质问她为何重获新生（暗示与复仇有关）。千束的选择与真相的揭露：松下先生进一步透露20年前家人遇害时，刃还和他在一起。他要求作为“阿兰之子”的千束理解重生的意义，亲手杀死刃。然而，千束拒绝杀人，表示虽然是Lycoris，但她想做救人的工作，就像赋予她人工心脏的人一样。刃趁机逃离，并让围观者快跑。米卡赶到现场，试图劝说松下先生离开。松下先生在混乱中再次不知所踪。刃与米卡的对峙及委托的真相：刃和米卡短暂对峙，刃认出了米卡及其手下的身手，并透露刺杀委托是三星期前一位女性现金支付的，他从不过问委托人细节。米卡追问20年前松下家人的死是否与刃有关，刃则反问米卡的腿怎样了（暗示米卡知情或参与）。胡桃此时查明真相，“松下先生”是两周前从医院失踪的晚期药物中毒患者，无法自主活动和说话，完全是借助护目镜摄像头、远程遥控轮椅和扬声器进行交流的替身。真实的“松下先生”并不存在，委托她们杀人的另有其人，目的不明。后续计划与彼岸花的未来：在另一处，某人与委托刺杀者通话，确认计划继续进行，并提到已经藏好四个集装箱，等待新的命令，事成后收益对半分。这暗示存在一个更大的组织或计划。刃则表示将开始对付“彼岸花”（Lycoris）。千束因被虚假的松下先生欺骗而感到失落，泷奈安慰她。最后，泷奈应千束的要求再次确认，证实了千束人工心脏没有心跳的事实。尾声：（无具体情节，应为收尾或ED部分，略去）
section1：DA（Direct Attack）司令部讨论遇袭队员数量增加的情况，袭击事件从二子玉川开始，蔓延到御台场、立川、品川。所有DA队员进入S级警戒。袭击者被称为“彼岸花”。据悉，遇袭的四名队员都是单独执行任务时遭到多人袭击。猜测袭击与之前放射线系统被黑有关。DA指示队员们近期不要单独行动。section2：Cafe LycoReco的成员（包括千束和泷奈）讨论DA遇袭事件。提到山岸医生说本月体检时间是昨天，泷奈没有去。千束提议从今天开始组队行动，并建议直到确认安全之前，她们24小时待在一起，晚上轮班守夜。千束邀请泷奈住在她家。section3：泷奈来到千束的安全屋。千束介绍这里是安全屋一号，她还有其他三间。为了公平分担共同生活的家务（做饭、洗衣服、打扫），千束提议用猜拳决定。两人开始猜拳，但泷奈似乎总是输。section4：在Cafe LycoReco，瑞希和胡桃正在忙碌（胡桃在玩游戏）。千束和泷奈加入。她们讨论DA遇袭事件，瑞希认为她们不是DA成员不用担心，但千束觉得有可能性。她们想帮忙阻止下一个人受害。千束试图向楠木司令获取情报，但被告知是机密。胡桃表示会去偷看DA的秘密信息。section5：真岛的组织讨论被雇佣入境日本的恐怖分子突然全部消失的事件，目标是查明原因并摧毁DA。真岛因为DA总部位置还没找到，对他的黑客（实为胡桃制造的诱饵）感到不满，因为为此损失了26个手下。真岛给黑客三天时间找到DA总部，威胁要打破“平衡”。section6：黑客（胡桃的诱饵）试图寻找DA总部位置遇到困难，政府专用基站使用了独立操作系统。她寻求帮助，询问谁安装了后门。所有人都指向“核桃”（胡桃）。黑客声称“核桃”已死，自己才是“神”。另一个黑客表示可以提供帮助，认为解析操作系统不现实，建议物理入侵交换机，但表示自己不会做。section7：电视新闻报道一名40多岁的无业男性因利用匿名通讯系统发布猥亵儿童视频和图片被捕。与此同时，真岛的黑客通过匿名通讯系统接入点的数据，成功下载了信息，其中包括被捕者（与目标Lycoris有关）的地址。section8：真岛的黑客找到了目标Lycoris的住址，但由于获取的信息源自非法内容，感到不适。另一边，泷奈在安全屋进行家务（猜拳输给了千束）。她们讨论猜拳胜率。闯入者警报响起，一群小混混进入目标Lycoris的住所寻找她，但目标 Lycoris 成功逃脱。section9：逃脱的Lycoris回到安全屋（千束的），报告窗户又被打坏了。千束解释安全屋就是应对这种情况的。她们讨论袭击者，千束提到以前“风铃草”（Lilybell，男性版彼岸花）也会来。她们猜测袭击者如何识别Lycoris。section10：真岛向他的黑客施压，三天时间已到。黑客被迫给真岛看了从DA无人机录像中截取的画面，显示枪支交易时DA的四名Lycoris被杀，犯人因此暴露了她们的长相。黑客承认是自己黑进了DA，导致录像外流和武器扩散，但声称是为了接近委托人。section11：Cafe LycoReco的成员得知胡桃就是当年黑进DA导致武器流出的黑客，瑞希对此表示愤怒，因为这间接导致了泷奈被降职。胡桃表示她只攻击了系统，并不知道后续。她们意识到，犯人正是通过这些录像识别并袭击Lycoris的。她们发现千束的长相也在录像中，意识到千束是下一个目标，并且她已经出去送货了。section12：千束在送货途中遭到埋伏袭击。她穿着便服，但里面穿着Lycoris制服。她试图用非致命弹药制服袭击者。真岛在远处观察战局。千束的格斗和躲避能力让她能够应对袭击者，但最终被真岛用实弹击中了腿部。section13：Cafe LycoReco的成员得知千束有危险，胡桃紧急黑进城市摄像头找到千束的位置。泷奈、瑞希和胡桃驾驶汽车前去救援。她们到达现场，泷奈掩护千束跳上车，瑞希开车逃离。一辆大型车辆追击她们，胡桃通过黑客手段将其瘫痪。section14：千束被救回Cafe LycoReco。她们也抓住了真岛派来的黑客（胡桃的诱饵），并将其带回咖啡馆。胡桃现身，承认自己就是当年黑进DA的黑客“Walnut”，当年为了接近委托人才接受了黑掉DA的任务。瑞希再次对胡桃表示不满，但泷奈认为自己被降职是自身行为的结果。section15：胡桃通过获取的信息，查明了袭击者的身份是真岛。她们决定抓住真岛。与此同时，真岛得知自己的黑客（诱饵）失手，但却发现了一个有趣的人（千束）。真岛对千束表现出极大的兴趣，认为她能与自己保持“平衡”，并要求获取更多关于彼岸花（千束）的信息。section16：千束的腿伤得到处理。她们讨论了千束的弱点（眼睛）和团队合作的重要性。千束提出为了安全，她们应该继续住在一起。她们再次通过猜拳决定家务，泷奈由于习惯性地先出石头，再次输给了千束，印证了胡桃之前关于千束预测能力的分析。
section1：DA特工讨论真岛的画像，质疑其准确性，并提及彼岸花的绘画训练以及躲避子弹的能力。section2：有人讨论彼岸花躲避子弹的能力，认为其水准异常，并好奇她的身份。section3：LycoReco咖啡馆，众人讨论漫画草稿截止日期和桌面游戏聚会。千束似乎被手机信息分散注意力，收到一条关于未来在BAR Forbidden见面的消息。section4：众人根据千束看到的短信，猜测BAR Forbidden见面的目的，包括猜想米卡和司令楠木之间可能有恋情，以及楠木可能试图将千束调回DA，导致LycoReco面临关门危机。大家表达了对咖啡馆可能关闭的担忧，并决定设法阻止。section5：真岛收到关于使用非致命子弹战斗的人的信息，联想到电波塔事件，确认此人（千束）与事件有关，并宣称自己曾弄塌电波塔。section6：真岛与核桃（Kurumi）讨论入侵DA系统的计划。核桃解释由于AI控制，需要物理连接才能打开系统后门，并自豪地表示自己是唯一能做到的人，渴望因此获得顶尖黑客的认可。section7：核桃执行入侵计划，制造了东京都内21处地区同时发现爆炸物的虚假警报，成功调离并延缓了彼岸花的反应速度。楠木司令识破是假画面，下令召回彼岸花。section8：电视新闻报道昨晚警局遭遇暴力团袭击的惨状。蕗和樱来到LycoReco，查看警局监控录像，发现真正的袭击者是真岛，而非新闻报道的暴力团成员。千束根据泷奈的描述认出真岛。蕗和樱接到命令匆匆离开。section9：真岛得知警局事件后确认自己的身份被曝光，向彼岸花发出挑战。section10：蕗和樱被召回。米卡有事外出。千束、泷奈、核桃前往BAR Forbidden，核桃远程开启了酒吧的门。section11：千束和泷奈使用核桃提供的假名进入BAR Forbidden。米卡抵达酒吧，与吉松信二会面。section12：千束无意中听到米卡和吉松关于自己心脏和天赋的对话，得知吉松与自己被救有关。她冲上前去，打断了两人的谈话。section13：米卡避开。千束向吉松表示感谢，并希望用新生命帮助他人。吉松强调彼岸花的天赋是杀戮，与千束的愿望冲突。千束和核桃插科打诨，假装成年人想喝酒。吉松让千束留下，并表示会等待她。section14：米卡和吉松私下交谈，吉松提及放走了某人（刃），并指出米卡的变化。米卡表示想给千束自由。吉松提醒米卡他们曾约定要将千束培养成绝无仅有的天才杀手。米卡内心独白表示自己没有杀人的决心。吉松随后与泷奈简短交流，表示LycoReco不适合千束，并期待泷奈的表现。section15：米卡问吉松为何对千束隐瞒真相。吉松称这是救千束的条件。米卡称赞吉松遵守了约定，欺骗了千束。米卡和千束回到LycoReco后相互道歉。section16：LycoReco咖啡馆内，顾客们（包括阿部先生）进行着桌面游戏聚会。水木打扮准备去高级酒吧，但核桃告知假身份已被清除。有两名看似是黑帮的人出现在咖啡馆外。千束抵达咖啡馆，加入大家后准备换装营业。section17：米卡和吉松继续他们的对话，谈论各自的使命。真岛和核桃确认系统连接成功，并决定要将事件闹得更大。
section1：姫蒲做的菜很好吃，被夸赞有当厨师的天分。她询问如果选择当厨师，机关是否会赞助。对方解释说机关赞助的天赋是神赐予的，没有选择，从出生起就决定了职责，认为这样很幸福，无需寻找人生意义。section2：讨论对千束要礼貌，但表示不确定。有人认为千束不能一直在那玩过家家。千束端来东西，被提醒这里不是酒馆，白天不能喝酒。她提到水木那里有剩酒。随后场景转到咖啡厅，千束在服务客人，生意似乎很好，泷奈帮忙端送餐点。泷奈觉得这样下去不妙。section3：水木抱怨咖啡厅亏钱，即使算上任务报酬也不够，弹药和公务交通费都成问题。提到千束花销大，尤其是贵的子弹和芭菲。水木抱怨虽然独立经营，但仍依靠DA的补助，并以前束的活动经费名义报销。泷奈自告奋奋提出今后负责LycoReco的会计工作。section4：泷奈要求千束行动时不要破坏现场，节省清洁费用。千束答应。在一次任务清理后，泷奈指出千束开枪太多。泷奈在咖啡厅继续监督开销，提醒不要浪费电。section5：在一次任务中，千束成功解决问题，仅打了一发子弹，泷奈夸她做得不错。section6：千束提出一种新的热可可芭菲，看起来很奇怪，但她坚持要制作。泷奈看到后觉得像“shi”，但碍于情面说挺好。胡桃过来帮忙，因为咖啡厅生意火爆，千束觉得太忙。顾客们对胡桃的可爱感到惊讶，询问她的年龄。section7：咖啡厅生意异常繁忙，泷奈和水木、胡桃都在忙碌。水木和胡桃在讨论投资股票，泷奈加入并询问，表现出对钱的渴望。section8：泷奈打电话给山岸医生，表示千束明天会去体检。她认为组员健康管理也是她的职责。后藤先生来到咖啡厅，得知千束不在，是晚上上班，由泷奈（穿着千束的衣服）接待。section9：泷奈表示那种看起来奇怪的芭菲以后不做了，虽然很受欢迎。RoboLyco帮忙处理掉了剩下的芭菲。section10：山岸医生再次打电话给泷奈，表示千束没有去体检，也不接电话。泷奈得知后表示会去找她。section11：千束在家中被真岛持枪对峙。真岛提到她的健康很重要，身体是本钱。千束问“我们”是什么意思，表示枪口对着她还谈“我们”，并说她活着才能留给他杀。真岛夸赞她厉害，问怎么做到的，是不是因为她的心脏。千束惊讶真岛知道这件事，真岛回答“秘密”。section12：真岛提到电影《虎胆龙威》，问千束喜欢谁，千束说喜欢鲍威尔警官，并表达了对鲍威尔和麦克莱恩搭档关系的理解。真岛提出给千束倒咖啡，千束说不喜欢苦的。section13：真岛问千束是否记得他，千束说记得他喷了她一脸（指饮料）。真岛提示更早以前的事，比如电波塔事件，试图让千束回忆。section14：回忆画面闪回电波塔事件，展示了当时千束处理敌人的高效。真岛在远处观察并引爆了炸弹。千束最终锁定了真岛的位置。section15：回忆中，千束和真岛对峙。真岛说还有一个人没解决。千束射击真岛，子弹似乎穿过了他，但最终真岛似乎引爆了什么，场面混乱。section16：回忆结束，回到现在。真岛对千束说别把他说的像怪物一样，千束说他实际上就是怪物，并问他是否想起来了。千束说不记得。真岛说也对。section17：真岛展示了自己也有Alan机关的吊坠。千束问他为什么要做这种事，认为他有天赋应该带来幸福，而不是做相反的事。真岛反驳千束也是个杀手。千束强调自己一直在帮助别人。section18：真岛认为千束把阿兰机关误认为推动和平的组织，指出除了千束，其他受赞助者都留下了推动和平的成果。他嘲讽千束是否想像拿奖牌的人一样感动世界，并说阿兰不是那样的机关。千束坚信自己和吉叔的约定，并展示了自己的吊坠作为证明。section19：真岛问吉叔是否是阿兰机关的人，千束说与他无关。真岛问千束是否与阿兰接触过，表示不清楚千束掌握多少情报，但自己只是按意愿做事。真岛说千束和他一样，并断言千束是因为有杀戮的本领才被赞助的。千束极力否认，认为阿兰很纯粹，能肯定他们的杀戮才能。section20：真岛准备离开，因为千束的搭档（泷奈）来了。他离开前说下次见，称呼千束为“电波塔彼岸花”。section21：泷奈赶到千束家，问真岛是否来过，是否被干掉了。千束说没有，真岛身上也有Alan吊坠。泷奈不解Alan为什么会赞助凶恶罪犯。千束猜测吊坠可能是真岛捡到的，吉叔不可能救那种人。她寻求米卡的认同，称呼他“老师”。米卡对此回应。section22：米卡告诉千束他的电话响三下以内必须接，否则他会认为有危险，会再拨一通响一声的电话暗示他会去找她。千束表示这说明无论她在哪里米卡都会来。米卡让她换一个安全屋，但千束喜欢现在的。真岛在离开前说还会去千束家玩，千束似乎误解为住一起或为她做饭，表现出兴奋。米卡让她赶紧工作。section23：泷奈注意到千束使用了一把不是DA配发的枪，千束解释是和Alan吊坠一起拿到的，是吉松给的，很珍贵。section24：大家在咖啡厅谈论天气转凉。千束提到泷奈来的那天樱花开了，从那时起吉叔就没有来过了。section25：泷奈给了千束一个在幼儿园发的玩具狗，因为千束想要。千束很高兴。泷奈说自己最近努力工作是为了这家店不倒闭，因为这是千束很重要的地方。千束感谢泷奈。section26：泷奈再次提醒千束去定期体检。千束答应但表现出不情愿。她承认害怕打针，虽然不怕枪，因为打针躲不开。泷奈对此感到惊讶，认为“电波塔彼岸花”居然害怕打针。section27：千束在诊所接受注射，表现得非常紧张，反复询问是否结束。结束后松了一口气，认为自己突破了最大的难关。她表示打针不仅疼，主要是被注入异物的感觉不舒服。她提到山岸医生说只是普通的维生素剂，但觉得今天的注射不一样。section28：泷奈在诊所外等待千束，礼貌地与护士交谈，并提到千束迟迟未到。泷奈显得有些不耐烦，起身离开。米卡责怪泷奈，似乎是针对某种后果。
section1：千束的心脏危机与诊断。section1_1：千束在某种危机后倒下，有人在呼唤她。section1_2：山岸医生解释说，千束的人工心脏遭到了破坏，有人通过高电压使其过载，导致无法通信和充电。这是一种简单但有效的破坏手段。section1_3：医生告知千束，心脏无法再充电，由于刚刚充过电，大约还能维持两个月，如果减少活动可能会更长一些。这是千束的剩余寿命。section1_4：泷奈愤怒地想去杀了破坏心脏的护士，但千束阻止了她，表示自己本来就没有那么长的命，杀掉对方也于事无补。section1_5：他们决定回咖啡馆，提到了一个因为泷奈不好意思而没做的芭菲。section2：DA的召集与真岛的行动。section2_1：千束回到LycoReco咖啡馆，以看板娘身份接待顾客。section2_2：千束去DA，因为楠木让她去拿东西。她和楠木姐讨论回DA的事。section2_3：楠木姐得知千束命不久矣，但仍希望她能回DA参加大规模讨伐真岛的行动。section2_4：楠木姐向千束展示了一个回收的文件箱，并表示找到真岛花费了很多力气。她认为千束应发挥天赋，而不是碌碌无为地死去。section2_5：千束提出如果DA允许泷奈回归，她就考虑参加行动。section2_6：泷奈和楠木会面，楠木给了泷奈让她回归DA的命令。section2_7：楠木告知泷奈，DA找到了真岛的据点，三天后将进行突击行动，需要战斗人员。泷奈得知自己可以回归，但反应并不激动。section2_8：千束对于泷奈得知回归DA后不显得开心感到疑惑，觉得她可能变得和自己一样傻了。section2_9：泷奈收到命令后迅速离开，处理了路上的敌人，并向千束道别，表示要去执行DA的任务。section3：对吉松和阿兰机关的调查。section3_1：核桃大神在吸烟，表示有罪恶感的时候就会想抽烟，权当惩罚自己。section3_2：核桃大神查了阿兰机关和吉松慎二，发现网上的信息都被删除干净，因此想找知情人询问，并特意泡了茶。section3_3：核桃大神询问米卡是否注意到静刃的刺杀和破坏千束心脏的女人可能都是吉松慎二指使的。section4：阿兰机关与千束的过去（闪回）。section4_1：米卡回忆起十年前，吉松慎二看着年幼睡着的千束，称赞她很棒。section4_2：吉松提到千束有先天性心脏病，半年内会死去，但他不会让这发生。section4_3：吉松展示了阿兰机关赞助的天才制造的完全替换型人工心脏，没有心跳，领先现有技术，但耐久性有问题，最多用到千束成年。section4_4：吉松认为千束有杀戮的天赋，应该将它带给全世界，这是最重要的条件。米卡表示会满足他的期待。section4_5：米卡询问吉松是否最初只将千束视为杀人工具，以及他何时改变了想法。吉松反问米卡是否擅长照顾小孩。section4_6：吉松拜托米卡在手术后帮助千束发挥天赋，强调这不是任务，而是他们之间的约定。section4_7：年幼的千束醒来见到了吉松，认出他是救了自己的人。吉松否认自己是救世主，千束感谢他，并询问如何报答。section4_8：吉松表示千束肩负着重大使命，让她完成使命，并称自己因此成为了“救世主”。section4_9：千束感谢救世主，并表示自己也会成为救世主。她请求救世主笑一个。section4_10：幼年千束害怕时，米卡安慰她会好起来的。她提到了“救世主先生”。section4_11：幼年千束收到“救世主”送的礼物，那是一把枪。她问这把枪是不是救人的枪。section5：揭示真相与泷奈的决定。section5_1：米卡表示吉松慎二从那以后就消失了，连他也见不到。section5_2：米卡和核桃大神推断，千束不杀人是受到了吉松那句“救人的枪”的影响，这与吉松最初的期待形成讽刺。section5_3：核桃大神认为吉松现在可能想除掉没有完成使命的千束，但米卡对此表示怀疑。section5_4：核桃大神意识到，盯上自己的阿兰机关成员可能也与吉松有关，并且吉松与拿到武器的真岛也有交集。section5_5：核桃大神推测，抓住真岛可能就能得知千束心脏的信息。米卡同意，并认为通过真岛下手比追查核桃大神更快。section5_6：核桃大神认为参加DA的行动是个机会。泷奈原本想拒绝回归DA，因为是千束生命最后的两个月了。section5_7：泷奈决定回归DA，因为这是千束活下去的唯一可能性。她打算去告诉千束。section5_8：米卡表示由他去告诉千束，让泷奈给他点时间。section5_9：千束一直在一旁偷听，她询问核桃大神说的“吉叔”是谁。核桃大神解释吉叔是赞助了千束的阿兰机关的代理人。section5_10：千束表示自己早知道了。核桃大神想到了一个计划。section6：告别 outing。section6_1：LycoReco的大家开心地接待顾客，但泷奈觉得过于吵闹。section6_2：泷奈告诉千束有话要说，然后拿出了她精心制作的“休假程序”计划书。section6_3：千束和泷奈按照计划出行。泷奈担心千束穿得单薄会冷，千束则表示是泷奈选的衣服。section6_4：千束挑选了泷奈的冬装，并认为泷奈是很好的模特素材。section6_5：泷奈按照计划催促千束离开，尽管她还没有买大衣。千束表示没有时间了。section6_6：计划赶不上变化，她们到达水族馆时发现临时闭馆了。section6_7：千束认为人生总是计划赶不上变化，并享受这种意外。她带着泷奈去钓鱼，但没钓到。section6_8：千束表示只要和泷奈在一起，做什么都很开心。时间到了，她们准备去下一个地点。section6_9：她们走得很远，泷奈再次抱怨没买大衣，千束把围巾借给她。section6_10：千束在等待雪，她说雪在九点开始下，这原本是完美计划的一部分，但“神明”很随性。section6_11：千束希望只有今天“神明”不要任性。泷奈问为什么。千束说是因为泷奈可以回DA了。section6_12：千束为泷奈能回DA感到高兴，询问她何时动身。泷奈说就在明天。section6_13：千束问泷奈是否不开心，泷奈表示不知道。千束说如果能下雪就好了，泷奈同意。section6_14：泷奈感慨这个世界不讲道理，但千束认为为无能为力的事情烦恼没用，接受事实并全力活下去通常会好起来。section6_15：千束告诉泷奈她的计划很成功，自己今天非常开心，并称赞泷奈干得不错。section6_16：千束表示今天之内必须给DA回复，泷奈让她去。section6_17：千束将围巾送给泷奈作为饯别礼，然后离开了。section7：吉松的到访。section7_1：有人试图联系慎二，但电话打不通。section7_2：米卡在场。section7_3：吉松慎二到访，对米卡说“初次见面”。
咖啡馆的决定与离别：讨论基于论文寻找特定人物的可能性，以及人工心脏实验的难度。提到阿兰机关提供了进行非法实验的机会，并将没有户籍的“彼岸花”视为理想对象。有人提出阿兰机关找到研究者应该有某种契机。咖啡馆的人们讨论店铺即将关门。店长（千束？）表示不希望大家浪费时间，希望店铺快乐到最后，并认为已经营业的时间比预期长。店长鼓励大家像泷奈一样回归自己的人生。水木表示她将在婚恋交友网站认识的温哥华帅哥，打算出国去见他。胡桃表示因为DA追查她，留在这个国家很危险，决定离开，店长建议去德国，胡桃同意并邀请店长一起去，可以帮忙办理护照，但店长以老师会孤单为由拒绝。胡桃表示未来会邀请泷奈去。真岛的阴谋与DA的应对：一份报告详细列举了从四月武器交易、地铁袭击、杀害“彼岸花”、袭击警局等一系列事件，确定主谋是名叫真岛的全球活动战争狂人，他十年前就曾出现并参与了电波塔事件，当时以为罪犯已被消灭。报告提到真岛接受国内外黑帮委托，目标是延空树。DA抓获其中一名委托人，得知了真岛的藏匿地点，下令全力攻击并击杀真岛。真岛与某人对话，提到心脏和误会，称对方冷酷，如果千束知道其偶像“吉叔”的真面目会失望。真岛提到电波塔事件让他捡回一命，并警告过阿兰机关，认为阿兰机关干预目标的成长违背了其原则。对方（吉松/慎二）表示千束误入歧途是他的疏失，会负责。真岛询问对方是否也会杀了他，对方称赞真岛是优秀的阿兰之子，并询问一千把枪是否够用。真岛拒绝知恩图报，声称自己和千束一样只会随心所欲地活着，并可以随心所欲地杀掉对方。对方表示如果能实现阿兰的理想，甘愿献出生命。真岛表示对他们这些躲在暗处、行伪善之事、操控世界的人感到不爽，威胁等DA完蛋了就轮到阿兰机关。DA部队追踪真岛，但目标跳过预测地点，DA认为将其逼入绝境并实施包围。真岛则信任自己的黑客，表示已为今天留好后门。千束的成长与吉松的真相：咖啡馆内，店长（米卡）和泷奈准备收拾店铺。米卡表示关门是千束的期望，泷奈表示自己什么都没说。泷奈提醒米卡还有自己。米卡给千束一个盒子，千束猜测是步枪，米卡让她打开，表示反正不是武器，不用锁门。千束打开发现是和服，米卡说是给她的礼服，虽然离成人礼还早。千束穿上和服，米卡给她拍照。千束询问感想，米卡称赞她很好看，已经是成熟女子。千束感谢米卡。米卡表示自己没做什么值得感谢的事，千束列举了米卡对她的重要意义，包括给她取名字、教她用枪、开店、让她遇见泷奈，最重要的是找到了“吉叔”。千束提议把照片发给“吉叔”，米卡突然大声制止。米卡表示有关于慎二（吉松）的话要告诉千束。米卡解释当初请慎二做手术是出于司令官的个人利益，当时只希望她作为“彼岸花”期间活着就好。慎二接受的条件是将她培养成最强的杀手。米卡惊讶并觉得不可能，因为吉松自称救世主。米卡解释是因为不敢告诉千束，怕打击她对慎二的尊敬，而这份尊敬支撑着她脆弱的生命。米卡询问是否应该告诉千束她的生活方式错了，是否应该多杀人才能让慎二来救她。千束感谢米卡给了她做决定的机会，表示如果知道了这些，她可能就会屈服，继续做“彼岸花”，并将烦恼怪罪给米卡和吉松，但她不愿意。她表示自己的工作和开店都是自己的决定，感谢米卡和吉松给了她这些机会，即使听了真相也一样，认为他们俩都是她的父亲，这是她最开心的事。米卡哭泣道歉，千束安慰他。千束问米卡是否喜欢这样的她，米卡表示当然，她是让他骄傲的女儿。延空树危机与彼岸花暴露：延空树完工典礼进行，彼岸花警卫就绪，典礼将进行广播电波发送。真岛的声音突然从延空树广播发出，向公众讲话。DA识别出是延空树的广播并试图屏蔽，预计需90秒。真岛声称带来真相，嘲讽日本的和平，认为其虚假且掩盖了恐怖活动，是对肮脏和平的执着，让他不爽。真岛透露自己在东京都内散发了大量物品（暗示是武器），这是他提供一千把枪的目的。楠木司令命令彼岸花不要接触持枪平民或开枪，意识到真岛的真正目的是暴露彼岸花的存在。现场有民众发现枪支，有人持枪要求他人丢弃。真岛广播鼓励持枪者保护自己，决定自己的行为，享受没有谎言的世界。延空树电波被屏蔽。DA总部联系楠木，质问缘由，认为可以管制信息，但真岛已向全国暗示了彼岸花存在，造成重大失态。总部要求立即派出锦木千束，声称养她就是为了此刻。楠木请求由她来设计行动，但总部坚持派出千束，表示别无选择。新闻报道政府宣布紧急事态，延空树被控制，电波被劫持，犯人是30多岁男性。楠木接到米卡电话。总部要求千束接听。千束接过电话，总部命令她立刻到总部会合，消灭延空树内的真岛。真岛的声音通过电话传来，威胁如果千束靠近延空树，某人（暗示吉松）将没命，并在1小时内引爆。总部表示需要千束帮助，事关多人的生命。真岛威胁千束出现会很棘手，人质性命取决于她的决定。千束表示稍后回电给楠木。真岛得意于千束没有轻举妄动，并表示一直在盯着她们。米卡认为这是陷阱，但千束表示不能看着吉松死。千束向米卡表示并不怀疑他，但要见到吉叔，听他亲口说。千束意识到武器库里的子弹可以用上，让米卡尽量多带。千束表示泷奈和蕗会保护好延空树，称赞她们也是优秀的学生，米卡同意。
DA行动简报与泷奈的担忧：DA司令官向特工们简报当前局势：真岛一伙已占据第二展望台，切断电梯并固守，DA尖兵将通过逃生楼梯突击夺回电梯。泷奈对指挥官说千束和店长失联，无法联系上，认为情况不对劲。泷奈寻求胡桃协助与水木的离别：泷奈利用加密频道联系了胡桃，胡桃自称已是超越核桃的最强黑客，同意协助。在机场，水木准备登机，感谢某人准备的特等舱票，而自己的票是经济舱。她对LycoReco的伙伴表示留恋，但决定离开，表示今后可能不会再见了。调查LycoReco与“吉松”线索：泷奈回到LycoReco，发现店门紧闭并挂着“暂停营业”的牌子。她发现千束的手机留在店里，再次联系胡桃，怀疑真岛可能对千束不利，询问真岛上次提到的“吉松”是谁。胡桃查出吉松是千束的恩人，心脏的提供者，认为真岛可能利用千束寻找吉松这一点设下圈套。寻找心脏提供者吉松：泷奈让胡桃调查与千束心脏或提供者相关的信息，特别是可能进行过心脏设计或手术的医学博士。胡桃通过面部比对和追溯10年数据，发现一篇论文作者，并定位到一个旧工厂。胡桃进行振动解析和声音监听，截获了一段对话，内容提及“实验体”、“阿兰的赞助”以及为那个女孩（千束）提供改良款心脏，似乎吉松医生与此有关，且吉松已经拿到了另一具心脏。泷奈违抗命令寻找千束：DA尖兵们准备通过楼梯突击。泷奈收到胡桃发来的千束手机照片，显示照片发出后吉松曾打电话给千束。结合米卡的车移动到押上，她们推测千束和米卡可能去了旧电波塔，去见心脏提供者。胡桃认为这是好事，但泷奈有不好的预感，怀疑是陷阱。尽管队友（蕗）劝说并提醒她在执行任务，泷奈仍决定退出任务去找千束，即使这意味着无法回到DA。另一位Lycoris（艾丽卡）代替了泷奈的位置。泷奈坚称她在这里救不了千束，这是她的理由。DA尖兵突击与真岛的行动：各队尖兵通过楼梯向第二展望台突击，计划夺回电梯控制权。楼梯间爆发激烈战斗。真岛通过某种方式劫持了DA的放射线系统，使其无法启动。他宣布自己是超越核桃的最强黑客，并开始向东京都内约一百人分发枪支，让他们第一次体验枪支和自由，并警告他们小心穿着制服的秘密特务“彼岸花”（Lycoris），指责她们为了维护和平神话不择手段。千束抵达旧电波塔并与真岛对峙：水木在机场被胡桃叫住，胡桃利用广播找到她，并告诉她千束心脏有另一具在吉松手上。水木对千束去旧电波塔替换心脏的事情感到惊讶。胡桃与水木一起前往。与此同时，千束抵达旧电波塔，呼唤“吉叔”，找到被绑起来的吉松。真岛出现，称千束为“英雄”，并用枪指着吉松，要挟千束。真岛直播暴露Lycoris：真岛在延空树（新塔）进行直播，展示DA特工（Lycoris）在塔内开枪的画面，向公众揭露政府秘密特务“彼岸花”的存在。他指责DA每年造成大量人口失踪，号召目睹真相的人们记住这一切，以此作为对抗DA的第一步。DA总部与延空树内的Lycoris通讯中断。真岛与千束的理念冲突：真岛与千束对峙，他知道千束能通过对手的细微动作预测射击线和时间，称赞她是阿兰感兴趣的天才。他自称是“听音”的，与千束的视觉相对。真岛嘲笑千束不使用实弹浪费了天赋，认为吉松也说了这一点。他提出与千束联手对抗阿兰机关。千束拒绝了他，表示她不关心真岛，并且不喜欢按照别人的要求生活。
section1：在旧电波塔，千束和泷奈面对敌人，弹药耗尽。泷奈赶到，透露自己已退出DA并抓住了真岛。section2：媒体报道延空树事件，DA指挥官指示“清理彼岸花”。风铃草部队被派往延空树执行清理任务，而现场的彼岸花部队则被命令待命。section3：吉松出现，与彼岸花部队对峙。千束赶到现场。吉松询问千束是否杀了真岛，千束表示被救过一命的自己无法夺走他人性命。section4：吉松坚持认为千束的职责是杀人以对世界做出贡献，并将她比作人偶。他试图拿走千束的非致命枪。米卡用非致命子弹射中吉松，阻止了他。section5：泷奈用实弹威胁吉松，要求交出装着千束人工心脏信息的公文包。她揭露吉松策划了一系列事件，包括利用真岛和黑客胡桃，并毁掉了千束先前的旧心脏。section6：吉松提议千束杀死自己，取走他的心脏以继续活下去。千束拒绝这样做。section7：泷奈情急之下试图开枪杀死吉松为千束获取心脏，但被千束阻止。吉松催促泷奈为了朋友使用实弹。section8：米卡介入，用实弹再次射中吉松。千束随后用非致命子弹射穿吉松，表达了对他不珍惜生命的厌恶，并表示她明白了有比世界更重要的事物。她归还了吉松的非致命子弹，并要他替自己好好活下去。section9：千束和泷奈在虎杖等人的直升机协助下撤离旧电波塔。她们通过新闻得知延空树被占领，DA正派遣风铃草部队消灭塔内的彼岸花。section10：延空树内，蕗和其他彼岸花面临风铃草部队的威胁。蕗坚持遵守待命命令，但其他人决定反击。section11：千束和泷奈决定前往延空树的控制室，利用胡桃的力量帮助被困的彼岸花。米卡给了千束一个弹夹（可能装着特殊弹药）。火花组织了伤员的撤离。section12：在延空树控制室，千束找到黑客机器仔。意外的是，本应已死的胡桃出现，通过远程操控与机器仔展开黑客对决。section13：胡桃技高一筹，成功定位并让警方逮捕了机器仔。胡桃随后控制了放射线系统，开始伪造信息。section14：胡桃通过媒体广播将延空树发生的战斗伪装成一场名为“彼岸花危机”的旅游宣传活动，成功愚弄了公众和部分DA人员。section15：看到千束出现在直播画面并得知核桃控制了系统后，DA司令楠木下令风铃草部队撤退。楠木接管了指挥权。section16：撤离后，千束和泷奈与蕗和樱相遇。蕗表达了对泷奈的恼火，但也感谢她的帮助。樱解释了泷奈为她被DA驱逐的事情，让樱得以留在DA。section17：彼岸花部队开始撤离，千束、泷奈与米卡和虎杖讨论后续。米卡与虎杖谈及了胡桃帮助他们，并决定不向楠木报告，以换取免责。section18：在电梯中，千束向泷奈展示了米卡给她的弹夹。电梯顶部，真岛再次出现。
延空树事件后续：在延空树顶层，受伤的彼岸花接受急救。Alpha 1汇报真岛出现在第二展望台，Alpha 2负伤急需输血。司令部指示Gamma点急救组前往，并要求播放第二展望台影像。电源被切断，Alpha 1报告备用电源不足，需要撤退。现场长官蕗与另一名彼岸花讨论命令与同伴安危的冲突，最终决定分头行动：一人撤退带走伤员，蕗则前往第二展望台协助千束，承担独自行动的责任。千束与真岛的最终对决（第一阶段）：千束在延空树顶层与真岛对峙。真岛透露这座塔的倒计时已启动，他放置了炸弹。他认为他的工作已经完成，DA对信息的管控最终会被人们的怀疑摧毁。他要求与千束进行一场不带帮手的决斗，称之前的对决不算数。千束穿着吉松送的衣服。米卡与吉松的对峙：米卡出现在吉松面前，认出他是袭击千束的女人（姫蒲）的同伴。吉松的腿伤似乎是伪装的，他称战士总是会留一手，特别是面对“意中人”（暗指米卡）。米卡指责他撒谎。吉松拿出千束退还的吊坠，表示千束没有理解他的用意，已经不再需要他。米卡认为孩子们认识世界，做出选择时就不应干涉。吉松问是否要告别，米卡指出心脏就在吉松胸口里。吉松认为千束不相信他从不撒谎的说法。他们都承认自己为千束而疯狂。吉松坚持需要自然的平衡，认为每个人都在做自己认为正确的事，这反而不好。千束与真岛的最终对决（第二阶段）：千束和真岛坐下，喝着饮料继续对话。真岛抱怨饮料太甜，认为试图改变世界成自己喜欢的样子会让人变成老人。千束则列举她喜欢的东西：城市运转前的宁静、和老师开的店、咖啡香气、客人、朋友、美食、地点等，表示对世界本身无所谓，只想为需要她的人尽一份力，希望能留在他们的记忆中。真岛表示最后需要她的人是他，称她是个混账东西。他们再次辩论谁是正义的英雄：是为日本找回平衡的人（真岛）还是维持现状的人（千束）。千束最终击败了真岛，真岛从塔上坠落。延空树事件善后与余波：媒体报道延空树事件，专家估算演出费用巨大，市政府对市民批判的回应含糊其辞，承认删除了录像并称之为“市政府的作品”。蕗和樱在DA接受任务，清理真岛遗留的枪支，报告回收数量和流入黑市数量，以及处理名单上的目标。他们看到关于“彼岸花危机”的电影海报，内容与他们的经历相似，但被宣传为“极限生存游戏体验”。新闻报道了澳网冠军之子的婚约，水木对此发表评论。米卡在咖啡馆被水木搭话，米卡朋友静刃也来访。有顾客点“千束特别款”，泷奈对此表示不满。泷奈追踪并找到千束：泷奈通过胡桃的帮助，在夏威夷的海滩上找到了千束。千束试图逃跑，泷奈对她开枪（非致命），成功阻止了她。两人重逢，泷奈表达了对千束安危的担忧和见到她活着的喜悦。她们回忆了彼此的“笨蛋”行为。泷奈确定千束还活着，并提议回去。真相大白与新的开始：千束和泷奈在夏威夷的住处。千束好奇泷奈如何找到她，泷奈说是胡桃帮忙的。泷奈递给千束一个手提箱，说是店长（米卡）带来的。手提箱里装着一颗新的人工心脏和一个设备。千束意识到吉松骗了她，将新的心脏留在了那里。她听了吉松的录音，吉松说他的死亡成就了她崭新人生的开端，祝愿她幸福生活。千束扔掉了之前从泷奈那里拿到的设备（可能是假心脏或吊坠）。她们讨论接下来要做什么，决定尝试做一些曾经放弃的事情。她们决定一起开始新的旅程。LycoReco咖啡馆夏威夷分店开业：LycoReco咖啡馆在夏威夷重新开业。米卡正在店里，接到楠木司令的电话。米卡告诉楠木他们现在不接工作，因为他们在夏威夷。楠木质疑他们的护照和位置，并警告不要派风铃草过来。千束接手电话，声称楠木是她的粉丝。一个年轻女孩，穿着彼岸花的制服，来到咖啡馆寻找千束，表明咖啡馆的新业务可能与彼岸花或类似组织有关，或者千束和泷奈在新地点继续为需要帮助的人服务。